ABSTRACT Objective: The aim of this study is to determine the prevalence, antimicrobial resistance and various resistance genes in Acinetobacter baumannii (A baumannii) from human clinical specimens at the payambaran and Baqiyatallah Hospitals in the city of Tehran, Iran, over a period of six months (September 2012 to March 2013). Methods: A total of 500 samples including blood, phlegm, urine, cerebrospinal fluid (CSF) and pus were collected from patients on admission in these hospitals. A baumannii was identified by using standard microbiological procedures and conventional polymerase chain reaction (PCR) technique. Antimicrobial susceptibility test was performed according to clinical and laboratory standard institute (CLSI) guidelines using Kirby-Bauer disc diffusion technique, while different resistance genes were detected using PCR method. Results: A total of 121 A baumannii was detected out of 500 samples, representing 24.20% period prevalence. A baumannii was detected from all the sample groups, but a higher prevalence was observed in the blood (43.87%) and phlegm (24.11%). Antibiotic resistance profile showed higher resistance of A baumannii to tetracycline (90.90%), trimethoprim (61.98%) and cotrimoxazole (51.23%), followed by aminoglycosides (9.91–31.40%). Relatively low resistance was observed to cephalosporins (16.52–20.66%), quinolones (6.61–9.91%) and macrolides (8.26–14.04%), while the lowest resistance was observed to carbapenems (3.3–5.78%), chloramphenicol and nitrofurantoin. Highest detection for resistant genes was observed for tetA (58.67%), aac (3)-IV (56.19%), sul1 (55.37%) and dfrA1 (48.76%). Relatively low detection was observed for aad A1, bla-genes (SHV, CTX-M, OXA-like, VIM, SIM and IMP) and lowest detection was observed for cat1 and cmlA, while no qnr gene was detected. Conclusions: Multidrug-resistant Acinetobacter infections are posing an increasing threat to the population in these communities. Carbapenems provide an effective option against infections caused by resistant A baumannii.
RESUMEN Objetivo: El objetivo de este estudio es determinar la prevalencia, resistencia antimicrobiana, y varios genes de resistencia frente a la Acinetobacter baumannii (A baumannii) de muestras clínicas humanas en el hospital de Payambaran y el de Baqiyatallah en la ciudad de Teherán, Irán, durante un período de seis meses (de septiembre de 2012 a marzo de 2013). Métodos: Se recogieron un total de 500 muestras, incluyendo muestras de sangre, flema, orina, líquido cefalorraquídeo (LCR), y pus de los pacientes al ingresar en estos hospitales. La A baumannii fue identificada mediante procedimientos microbiológicos estándar y la técnica de reacción en cadena de la polimerasa (RCP) convencional. La prueba de susceptibilidad antimicrobiana se realizó según las guías de Clinical and Laboratory Standards Institute (CLSI), usando la técnica de difusión en disco de Kirby-Bauer, mientras que los diferentes genes de resistencia fueron detectados usando el método de RCP. Resultados: Un total de 121 A. baumannii fue detectado en las 500 muestras, representando un 24.20% de prevalencia en el período. A. baumannii fue detectada en todos los grupos muestrarios, pero la prevalencia más alta se observó en la sangre (43.87%) y la flema (24.11%). El perfil de resistencia a los antibióticos mostró mayor resistencia de A. baumannii a la tetraciclina (90.90%), la trimetoprima (61.98%) y el cotrimoxazol (51.23%), seguido por los aminoglucósidos (9,91-31.40%). Una resistencia relativamente baja se observó en las cefalosporinas (16.52-20.66%), las quinolonas (6.61-9.91%) y los macrólidos (8.26 – 14.04%), mientras que la resistencia más baja se observó en las carbapenemas (3.3-5,78%), el cloranfenicol y la nitrofurantoína. La mayor detección de genes resistentes se observó en tetA (58.67%), aac 3-IV (56.19%), sul1 (55.37%) y dfrA1 (48.76%). Una detección relativamente baja se observó en aad A1, genes bla (SHV, CTX-M, tipo OXA, VIM, SIM e IMP), en tanto que la detección más baja se observó en cat1 y cmlA, no detectándose ningún gen qnr. Conclusiones: Las infecciones por Acinetobacter multirresistentes representan una creciente amenaza para la población de estas comunidades. Las carbapenemas proveen una opción efectiva contra las infecciones causadas por A. baumannii resistente.